Science新技术目睹癌细胞在药物面前的真面孔

原标题：Science：新技能，目睹癌细胞在药物面前的“真面孔”

《Science》杂志上报导了一项新的细胞应对挑选技能——sci-Plex，可以搜集不同的细胞，并显现被药物处理时单个细胞发作的改变，比较于现在典型的高通量化学挑选法（HTS），不只局限于大略的读数（如细胞存活率，增殖或细胞形状的改变），或特定的分子发现，这为探究药物机制供给强有力的数据。

DOI: 10.1126/science.aax6234

经过将细胞核的符号技能和单细胞组合索引（sci-RNA-seq）兼并，使得剖析在单细胞分辨率下以经济有用的方法完结，该项技能被称为“sci-Plex”。

sci-Plex：细胞哈希和多样本sci-rna-seq结合检测

成果显现，散列寡核苷酸以一种与sci-RNA-seq兼容的方法稳定地符号细胞核，促进了绝大多数种间(95.5%)和种内两层态的判定，且不易发觉。

为了评价sci-Plex和HTS，研讨人员将其应用于K562（白血病），A549（肺癌）和MCF7（乳腺癌）的三种癌细胞系的筛查中，用188种用于癌症，HIV和本身免疫性疾病的药物处理他们，细胞用小的单链DNA的核散列符号。研讨人员总共对大约5000个独立样本中的65万个单细胞转录序列进行描绘，区别通用和细胞系特异性分子对每种化合物的反响。

sci-Plex可以在一个试验中对数千种化学扰动进行大局转录剖析

均匀流形近似和投影（Uniform Manifold Approximationand Projection，UMAP）将每个细胞系的大部分细胞投射成一个中心团块，周围是较小的团簇。试验中，最高剂量的药物处理后，只要52种(27%)化合物导致癌细胞存活率下降50%或更多。

其间，癌症药物组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase，HDAC)按捺剂对细胞处理的化合物反响最明显，研讨人员更深化地研讨了HDAC按捺剂的效果方法，发现基因调理的改变与这些按捺剂经过阻挠获取能量来阻挠癌细胞添加相一致。

HDAC按捺剂一起转录应对标明缺少乙酰辅酶A

跟着染色质结合乙酸盐的添加，这些转录反响标明HDAC按捺的细胞中，其乙酰辅酶A储藏会随之削减。

整体而言，Sci-Plex成果标明可以将其缩放至数千个样品，以靶向多种生化途径，催化剂，调理剂和效果方法。

资深作者Trapnell说：“这项研讨可以在必定程度上协助医学研讨人员了解某些药物怎么发生效果，细胞阶段怎么影响效果，以及为什么某些药物只对特定细胞有用。”

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参考资料：

[1] Techniqueshows how individual cancer cells react to drugs

[2] Sanjay RSrivatsan, José L. McFaline-Figueroa, Vijay Ramani, Lauren Saunders, JunyueCao, Jonathan Packer, Hannah A. Pliner, Dana L. Jackson, Riza M. Daza, LenaChristiansen, Fan Zhang, Frank Steemers, Jay Shendure, Cole Trapnell. Massivelymultiplex chemical tranomics at single cell resolution. Science, 2019;eaax6234 DOI: 10.1126/science.aax6234

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